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CCD的优势在于，经它扫描的图像质量较高，具有一定的景深，能扫描凹凸不平的物体；温度系数较低，对于一般的工作，周围环境温度的变化可以忽略不计。CCD的缺点有：由于组成CCD的数千个光电三极管的距离很近（微米级），在各光电三极管之间存在着明显的漏电现象，各感光单元的信号产生的干扰降低了扫描仪的实际清晰度；由于采用了反射镜、透镜，会产生图像色彩偏差和像差，需要用软件校正；由于CCD需要一套精密的光学系统，故扫描仪体积难以做得很小。

CIS的中文名称是接触式图像感应装置。它采用触点式感光元件（光敏传感器）进行感光，在扫描平台下1mm～2mm处，300～600个红、绿、蓝三色LED（发光二极管）传感器紧紧排列在一起，产生白色光源，取代了CCD扫描仪中的CCD阵列、透镜、荧光管和冷阴极射线管等复杂机构，把CCD扫描仪的光、机、电一体变成CIS扫描仪的机、电一体。用CIS技术制作的扫描仪具有体积小、重量轻、生产成本低等优点，但CIS技术也有不足之处，主要是用CIS不能做成高分辨率的扫描仪，扫描速度也比较慢。

SCSI扫描仪也是很典型的一种扫描仪，具体安装步骤如下：关闭计算机，打开机箱盖；选择一个空槽，并卸去挡板；从防静电口袋中取出SCSI卡；将SCSI卡插入空槽，并拧紧螺钉；将SCSI电缆的一端连接到扫描仪的SCSI插口，拧紧螺钉；将SCSI电缆的另一端连接到SCSI接口卡，拧紧螺钉；连接扫描仪电源线；打开扫描仪锁，很多厂商都设计了一个锁定机构，用于锁定扫描仪的镜头组建。打开扫描仪电源，等到状态指示灯停止闪烁并保持常亮。打开计算机电源，等到计算机启动完毕。安装扫描仪TWAIN驱动程序。

由于扫描仪的静电特性灰尘和污物十分容易吸附、堆积，使光学器件、传动器件的功率受到的影响。长期这样内部机械器件会受到磨损，扫描仪会发生扫描响声大、图像错位、图像模糊等问题，因此清洁是扫描仪保养至关重要的步骤。

扫描仪重要性能指标是光学分辨率，但存在一个误区，分辨率越高越好。从消费角度来看，不应盲目追求高配置，否则将造成资源浪费。综合评价一台扫描仪是优是劣，不能仅从分辨率来看。选购时应根据实际工作需要和输出设备的精度进行选择。

扫描仪的接口类型对扫描仪的应用和扫描速度有一定的影响。扫描仪和其他外设产品一样，USB接口因其支持热插拔、安装简单且传输速度较快而成为市场主流。